В этой пещере на Малой горе апостол Фома прожил 2 года своей жизни и был преследуем за свои христианские проповеди местными браминами, которые, как и фарисеи Иудеи, не разделяли убеждения Иисуса Христа "кесарю кесарево" ;) и тяготели к формулировке "брамину кесарево". Когда агрессивная толпа пришла в очередной раз, св. Фома сбежал от преследования через окно с тыльной стороны пещеры и поселился на холме св. Фомы в Ченнае, где он прожил 4 года и был убит (пронзён пикой) местным брамином за его проповеди, в числе прочего игнорирующие индусскую кастовую систему.

   Святой Фома известен как лидер молчаливых апостолов. Христианство имеет крепкий фундамент в Индии, заложенный апостолом св. Фомой. Когда португальский мореплаватель Васко да Гама приплыл в Индию в 1492 году, здесь уже было около миллиона христиан – примерное такой же процент от общего населения Индии, как и сейчас. Исторические доказательства миссии св. Фомы в Индии имеются во множестве.

      Апостол св. Фома приплыл в Кералу, как считается, в 51-52 гг. (по другим данным – гораздо позже, где-то в середине первой половины второго века), и сформировал христианство в Керале, окрестив местных жителей. Обычно они упоминаются как сирийские христиане. Св. Фома основал 7 известных церквей в Керале, прожив там 12 лет.

      После Кералы апостол прибыл в Милайпур (ныне часть г. Мадраса), прожив 2 года на Малой горе и затем ещё 4 года на горе св. Фомы. Раджа (царь Махадеван) был крещён и часть его подданных уверовали в евангелие. Это возбудило ненависть и ревность представителей высшего класса общества и священников-браминов, и, в конце концов, апостол св. Фома был проткнут копьём на горе св. Фомы во время молитвы перед крестом, вырезанным из камня лично св. Фомой, и таким образом Он стал мучеником. Он умер, обнимая этот крест, и был похоронен на том месте, где ныне находится католическая базилика св. Фомы на берегу моря в Ченнае (Мадрасе). После долгой череды событий мощи св. Фомы были вывезены Ватиканом.

      Невозможно поведать все чудеса, сотворённые св. Фомой, когда Он складывал руки в форме креста – руки, которые трогали раны Господа Иисуса Христа. Некоторые из этих чудес таковы: св. Фома воскресил к жизни 29 умерших людей; изгнал бесов из 250 одержимых; излечил 330 прокажённых; сделал зрячими 250 слепых, вернул способность двигаться 120 парализованным и способность говорить 20 глухим. Он исцелил 280 безнадёжно больных людей, от которых отказались врачи.

      Хотя св. Фома был очень дорог местному царю Махадевану, в действительности с ним обращались жестоко по меньшей мере несколько раз в Его жилище в отсутствие царя. Для спасения своей жизни Он, как утверждается, нашёл прибежище в джунглях Малой горы, расположенной рядом с Милайпуром. Пещера в пригорке предоставила Ему идеальную защиту, и эта пещера доступна для посещения и поныне.

      Внутри пещеры имеется валун, на котором виден отпечаток большой стопы с пальцами ног и изображёнными пятнами крови. Местные жители считают, что этот отпечаток возник чудотворным образом от наложения рук св. Фомы, которыми Он в своё время трогал раны Христа.

      Позади церкви вы можете видеть крест, высеченный св. Фомой на каменной поверхности скалы, где святой, как считают, проводил литургии и долгие часы в молитве и медитации. Этот крест в целом похож на другой, высеченный св. Фомой на горе св. Фомы, который считается чудотворным. На нём несколько раз выступала каплями кровь во время литургий между 1551 и 1704 годами, особенно 18-ого декабря. Всякий раз, когда на кресте на горе св. Фомы появлялись капли крови и менялся его цвет, подобные изменения наблюдались также и на кресте на Малой горе.

      На скале позади церкви рядом с крестом имеется чудотворный источник, называемый бесконечным источником святого. Только в 1765 году была сделана запись о том, что "люди, которые приходили толпами, чтобы услышать его проповеди, сильно мучились от жажды. Святой встал на колени в молитве и ударил по скале своим посохом, и в тот же миг там образовался источник для утоления жажды людей". Воду из этого источника черпают и поныне, и имеются свидетельства об исцелении этой водой.