Храм Пашупатинатх посвящён божеству Пашупати — одной из форм Шивы. Из-за периодической политической обособленности Непала культ Пашупати не успел окончательно слиться с индуизмом, в отличие от большинства других культов, составляющих современный индуизм, и ныне Пашупати считается главным индуистским божеством Непала, 90% населения которого составляют индуисты. Храм Пашупатинатх является своеобразным непальским аналогом индийского Варанаси, особенно кремационного гхата Маникарника в Варанаси.